Precise generation of systems biology models from KEGG pathways

نویسندگان
چکیده

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

CyKEGGParser: tailoring KEGG pathways to fit into systems biology analysis workflows

The KEGG pathway database is a widely accepted source for biomolecular pathway maps. In this paper we present the CyKEGGParser app ( http://apps.cytoscape.org/apps/cykeggparser) for Cytoscape 3 that allows manipulation with KEGG pathway maps. Along with basic functionalities for pathway retrieval, visualization and export in KGML and BioPAX formats, the app provides unique features for computer...

متن کامل

BioJS component to visualize KEGG Pathways

Signaling pathways provide essential information on complex Summary: regulatory processes within the cell. They are moreover widely used to interpret and integrate data from large-scale studies, such as expression or functional screens. We present KEGGViewer a BioJS component to visualize KEGG pathways and to allow their visual integration with functional data. KEGGViewer is an open-source tool...

متن کامل

coordination of protective schemes in distribution and subtransmission systems including distributed generation

نصب منابع پراکنده در سیستم های توزیع و فوق توزیع علاوه بر مزیت های فراوان، مشکلاتی را هم به همراه دارد. یکی از این مشکلات تأثیر این منابع روی اندازه جریان های اتصال کوتاه است. به طور معمول از حفاظت های مبتنی بر اصل جریان زیاد در سیستم های توزیع و فوق توزیع استفاده می شود. از مهمترین طرح های حفاظتی استفاده شده در فیدرهای توزیع، حفاظت فیوز- ریکلوزر است. همچنین از طرح های حفاظتی جریان زیاد جهتی در...

Tropicalization of systems biology models

Systems biology use networks of biochemical reactions as models for cellular process. The dynamics of reaction networks with many well separated time scales, is well captured by asymptotic models obtained by tropicalization of the smooth dynamics, via the Litvinov-Maslov correspondence principle. The tropicalized models can be used to check the global stability and to identify sensitive paramet...

متن کامل

Molecular profiles to biology and pathways: a systems biology approach

Interpreting molecular profiles in a biological context requires specialized analysis strategies. Initially, lists of relevant genes were screened to identify enriched concepts associated with pathways or specific molecular processes. However, the shortcoming of interpreting gene lists by using predefined sets of genes has resulted in the development of novel methods that heavily rely on networ...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: BMC Systems Biology

سال: 2013

ISSN: 1752-0509

DOI: 10.1186/1752-0509-7-15